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核DNAからさぐる日本のルーツ
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核DNAからさぐる日本のルーツ（5）核ゲノムのSNPに着目
斎藤成也（国立遺伝学研究所 ゲノム・進化研究系 特任教授）
科学の発達により、ミトコンドリアDNAに着目するのではなく、ヒトゲノムを分析する方法が近年、登場し、これによって得られるデータが膨大に増えた。今回は、核ゲノムを用いた新たな研究手法について解説する。（全11話中第5話）
時間：11分08秒
収録日：2018年9月26日
追加日：2019年4月3日
収録日：2018年9月26日
追加日：2019年4月3日
≪全文≫
●核ゲノムの、個人個人の違いに着目するという方法
とにかくミトコンドリアではよく分かりません。ではどうするのかということで、いよいよ核ゲノムの話に入ります。
核ですが、nuclear、核爆発、核分裂は全て同じことで、ウラニウムの核、つまり原子核です。ここでいう核は、細胞の核です。ただ、どちらも日本語では同じようにいいますし、英語でも「nuclear」「nucleus」と同じようにいいます。その中のちょっとした個人個人の違いを専門用語で「SNP（Single Nucleotide Polymorphism）」、日本語では「単一塩基多型」と呼んでいます。
ちなみに、日本の分子遺伝学、分子生物学では、「Nucleotide（ヌクレオチド）」は普通「nucleic acid」に関係することなので核酸と訳すべきですが、その中の大事なbase（塩基）だけに着目して「塩基」と訳すことが多い。つまり、ここでは一種の意訳で、単一ヌクレオチド多型なのですが、それを日本語では「単一塩基多型（single basic）」と訳しています。これは日本の特殊事情です。
なぜそれでいいのかですが、説明すると少し話が長くなります。DNA（デオキシリボ核酸）は、塩基、リン酸、デオキシリボースがつながったものであり、塩基が一番大事です。塩基には4種類あります。スライドにはA（adenine、アデニン）とG（guanine、グアニン）しか書いてありませんが、その横にC（cytosine、シトシン）とT（thymine、チミン）があり、つまり4種類あるということです。アルファベット順にいうと、A、C、G、Tの4つです。この違いは塩基の違いです。ですから、DNAの違いとは結局、塩基の違いのことなのです。
●核ゲノムにおいて人間は皆99.9%同じである
さて、人のゲノムは32億ありますが、その中で個人個人で違っているのは数百万です。片や約30億（32億）で、10の9乗です。億が10の8乗ですから、30億というと3×10の9乗、莫大な数です。それに対して、個人個人で違っているのは数百万です。10の6乗です。したがって、単純に比較していただくと、結局99.9パーセント以上、われわれはみんな同じです。ですから、赤の他人といって全然違うように見えるとわれわれは考えますが、実はほとんど同じなのです。だいたいチンパンジーもわれわれと99パーセント同じですから、全然違う生物種（動物）ですが、DNAで見るとチンパンジーもわ...
●核ゲノムの、個人個人の違いに着目するという方法
とにかくミトコンドリアではよく分かりません。ではどうするのかということで、いよいよ核ゲノムの話に入ります。
核ですが、nuclear、核爆発、核分裂は全て同じことで、ウラニウムの核、つまり原子核です。ここでいう核は、細胞の核です。ただ、どちらも日本語では同じようにいいますし、英語でも「nuclear」「nucleus」と同じようにいいます。その中のちょっとした個人個人の違いを専門用語で「SNP（Single Nucleotide Polymorphism）」、日本語では「単一塩基多型」と呼んでいます。
ちなみに、日本の分子遺伝学、分子生物学では、「Nucleotide（ヌクレオチド）」は普通「nucleic acid」に関係することなので核酸と訳すべきですが、その中の大事なbase（塩基）だけに着目して「塩基」と訳すことが多い。つまり、ここでは一種の意訳で、単一ヌクレオチド多型なのですが、それを日本語では「単一塩基多型（single basic）」と訳しています。これは日本の特殊事情です。
なぜそれでいいのかですが、説明すると少し話が長くなります。DNA（デオキシリボ核酸）は、塩基、リン酸、デオキシリボースがつながったものであり、塩基が一番大事です。塩基には4種類あります。スライドにはA（adenine、アデニン）とG（guanine、グアニン）しか書いてありませんが、その横にC（cytosine、シトシン）とT（thymine、チミン）があり、つまり4種類あるということです。アルファベット順にいうと、A、C、G、Tの4つです。この違いは塩基の違いです。ですから、DNAの違いとは結局、塩基の違いのことなのです。
●核ゲノムにおいて人間は皆99.9%同じである
さて、人のゲノムは32億ありますが、その中で個人個人で違っているのは数百万です。片や約30億（32億）で、10の9乗です。億が10の8乗ですから、30億というと3×10の9乗、莫大な数です。それに対して、個人個人で違っているのは数百万です。10の6乗です。したがって、単純に比較していただくと、結局99.9パーセント以上、われわれはみんな同じです。ですから、赤の他人といって全然違うように見えるとわれわれは考えますが、実はほとんど同じなのです。だいたいチンパンジーもわれわれと99パーセント同じですから、全然違う生物種（動物）ですが、DNAで見るとチンパンジーもわ...
